Protein–RNA interactions for Protein: P28066

PSMA5, Proteasome subunit alpha type-5, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA5P28066 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMA5P28066 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMA5P28066 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMA5P28066 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMA5P28066 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMA5P28066 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMA5P28066 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMA5P28066 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMA5P28066 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMA5P28066 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMA5P28066 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMA5P28066 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMA5P28066 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMA5P28066 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMA5P28066 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMA5P28066 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMA5P28066 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMA5P28066 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMA5P28066 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMA5P28066 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMA5P28066 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMA5P28066 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMA5P28066 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMA5P28066 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMA5P28066 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMA5P28066 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMA5P28066 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMA5P28066 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMA5P28066 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMA5P28066 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMA5P28066 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMA5P28066 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMA5P28066 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMA5P28066 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMA5P28066 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMA5P28066 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMA5P28066 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMA5P28066 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMA5P28066 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMA5P28066 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMA5P28066 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMA5P28066 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMA5P28066 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMA5P28066 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMA5P28066 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMA5P28066 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMA5P28066 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMA5P28066 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMA5P28066 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMA5P28066 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMA5P28066 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMA5P28066 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMA5P28066 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMA5P28066 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMA5P28066 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMA5P28066 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMA5P28066 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMA5P28066 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMA5P28066 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMA5P28066 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMA5P28066 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMA5P28066 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMA5P28066 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMA5P28066 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMA5P28066 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMA5P28066 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMA5P28066 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMA5P28066 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMA5P28066 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMA5P28066 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMA5P28066 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMA5P28066 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMA5P28066 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMA5P28066 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMA5P28066 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMA5P28066 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMA5P28066 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMA5P28066 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMA5P28066 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMA5P28066 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMA5P28066 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMA5P28066 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMA5P28066 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMA5P28066 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMA5P28066 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMA5P28066 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMA5P28066 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMA5P28066 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMA5P28066 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMA5P28066 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMA5P28066 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMA5P28066 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMA5P28066 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMA5P28066 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMA5P28066 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMA5P28066 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMA5P28066 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMA5P28066 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMA5P28066 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMA5P28066 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms