Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SYT1P21579 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYT1P21579 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYT1P21579 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYT1P21579 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYT1P21579 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYT1P21579 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYT1P21579 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYT1P21579 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYT1P21579 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYT1P21579 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYT1P21579 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYT1P21579 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYT1P21579 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYT1P21579 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYT1P21579 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SYT1P21579 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYT1P21579 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYT1P21579 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYT1P21579 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SYT1P21579 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYT1P21579 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYT1P21579 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYT1P21579 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYT1P21579 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYT1P21579 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYT1P21579 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYT1P21579 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYT1P21579 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYT1P21579 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYT1P21579 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYT1P21579 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYT1P21579 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYT1P21579 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYT1P21579 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYT1P21579 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYT1P21579 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYT1P21579 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYT1P21579 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYT1P21579 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYT1P21579 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYT1P21579 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYT1P21579 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYT1P21579 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SYT1P21579 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYT1P21579 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYT1P21579 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYT1P21579 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYT1P21579 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYT1P21579 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYT1P21579 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYT1P21579 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYT1P21579 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SYT1P21579 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SYT1P21579 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYT1P21579 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYT1P21579 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYT1P21579 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYT1P21579 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYT1P21579 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYT1P21579 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYT1P21579 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYT1P21579 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYT1P21579 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYT1P21579 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYT1P21579 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYT1P21579 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYT1P21579 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYT1P21579 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYT1P21579 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYT1P21579 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYT1P21579 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYT1P21579 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYT1P21579 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYT1P21579 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYT1P21579 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYT1P21579 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYT1P21579 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYT1P21579 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYT1P21579 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYT1P21579 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYT1P21579 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYT1P21579 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SYT1P21579 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYT1P21579 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SYT1P21579 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYT1P21579 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYT1P21579 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYT1P21579 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYT1P21579 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYT1P21579 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYT1P21579 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYT1P21579 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYT1P21579 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYT1P21579 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYT1P21579 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYT1P21579 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYT1P21579 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYT1P21579 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYT1P21579 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
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