Protein–RNA interactions for Protein: P14678

SNRPB, Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPBP14678 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms