Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CBX7O95931 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBX7O95931 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBX7O95931 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBX7O95931 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBX7O95931 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBX7O95931 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBX7O95931 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX7O95931 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX7O95931 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX7O95931 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX7O95931 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX7O95931 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX7O95931 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX7O95931 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX7O95931 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX7O95931 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX7O95931 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX7O95931 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX7O95931 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX7O95931 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX7O95931 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX7O95931 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX7O95931 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX7O95931 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX7O95931 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX7O95931 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX7O95931 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX7O95931 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX7O95931 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX7O95931 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX7O95931 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CBX7O95931 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CBX7O95931 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CBX7O95931 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CBX7O95931 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CBX7O95931 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CBX7O95931 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CBX7O95931 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CBX7O95931 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CBX7O95931 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CBX7O95931 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CBX7O95931 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CBX7O95931 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CBX7O95931 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CBX7O95931 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CBX7O95931 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CBX7O95931 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CBX7O95931 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CBX7O95931 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CBX7O95931 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CBX7O95931 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CBX7O95931 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CBX7O95931 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CBX7O95931 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CBX7O95931 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CBX7O95931 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CBX7O95931 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CBX7O95931 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CBX7O95931 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CBX7O95931 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CBX7O95931 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CBX7O95931 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CBX7O95931 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CBX7O95931 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CBX7O95931 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CBX7O95931 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CBX7O95931 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CBX7O95931 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CBX7O95931 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CBX7O95931 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CBX7O95931 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CBX7O95931 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CBX7O95931 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CBX7O95931 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CBX7O95931 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CBX7O95931 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CBX7O95931 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CBX7O95931 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CBX7O95931 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CBX7O95931 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CBX7O95931 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CBX7O95931 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CBX7O95931 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CBX7O95931 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CBX7O95931 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CBX7O95931 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CBX7O95931 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CBX7O95931 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CBX7O95931 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CBX7O95931 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CBX7O95931 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CBX7O95931 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CBX7O95931 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CBX7O95931 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CBX7O95931 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CBX7O95931 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CBX7O95931 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CBX7O95931 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CBX7O95931 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms