Protein–RNA interactions for Protein: O95104

SCAF4, Splicing factor, arginine/serine-rich 15, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF4O95104 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCAF4O95104 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms