Protein–RNA interactions for Protein: O94887

FARP2, FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,054 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARP2O94887 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FARP2O94887 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FARP2O94887 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FARP2O94887 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FARP2O94887 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FARP2O94887 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FARP2O94887 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FARP2O94887 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FARP2O94887 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FARP2O94887 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FARP2O94887 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FARP2O94887 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FARP2O94887 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FARP2O94887 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FARP2O94887 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FARP2O94887 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FARP2O94887 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FARP2O94887 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FARP2O94887 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FARP2O94887 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FARP2O94887 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FARP2O94887 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FARP2O94887 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FARP2O94887 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FARP2O94887 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FARP2O94887 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FARP2O94887 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FARP2O94887 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FARP2O94887 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FARP2O94887 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FARP2O94887 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FARP2O94887 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FARP2O94887 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FARP2O94887 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FARP2O94887 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FARP2O94887 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FARP2O94887 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FARP2O94887 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FARP2O94887 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
FARP2O94887 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FARP2O94887 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FARP2O94887 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FARP2O94887 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FARP2O94887 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
FARP2O94887 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FARP2O94887 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FARP2O94887 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FARP2O94887 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
FARP2O94887 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FARP2O94887 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FARP2O94887 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FARP2O94887 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FARP2O94887 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FARP2O94887 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FARP2O94887 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FARP2O94887 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FARP2O94887 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FARP2O94887 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FARP2O94887 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FARP2O94887 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FARP2O94887 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FARP2O94887 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FARP2O94887 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FARP2O94887 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FARP2O94887 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FARP2O94887 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FARP2O94887 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FARP2O94887 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FARP2O94887 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FARP2O94887 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FARP2O94887 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FARP2O94887 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FARP2O94887 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FARP2O94887 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FARP2O94887 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FARP2O94887 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FARP2O94887 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FARP2O94887 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FARP2O94887 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FARP2O94887 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FARP2O94887 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FARP2O94887 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FARP2O94887 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FARP2O94887 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FARP2O94887 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FARP2O94887 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
FARP2O94887 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FARP2O94887 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FARP2O94887 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FARP2O94887 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FARP2O94887 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FARP2O94887 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FARP2O94887 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FARP2O94887 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FARP2O94887 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
FARP2O94887 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FARP2O94887 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FARP2O94887 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FARP2O94887 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FARP2O94887 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms