Protein–RNA interactions for Protein: O75400

PRPF40A, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 957 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40AO75400 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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