Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms