Protein–RNA interactions for Protein: O60547

GMDS, GDP-mannose 4,6 dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDSO60547 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GMDSO60547 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GMDSO60547 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GMDSO60547 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GMDSO60547 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GMDSO60547 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GMDSO60547 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GMDSO60547 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GMDSO60547 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GMDSO60547 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GMDSO60547 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GMDSO60547 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GMDSO60547 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GMDSO60547 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GMDSO60547 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GMDSO60547 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GMDSO60547 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GMDSO60547 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GMDSO60547 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GMDSO60547 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GMDSO60547 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GMDSO60547 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GMDSO60547 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GMDSO60547 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GMDSO60547 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GMDSO60547 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GMDSO60547 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GMDSO60547 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GMDSO60547 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GMDSO60547 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GMDSO60547 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GMDSO60547 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GMDSO60547 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GMDSO60547 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GMDSO60547 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GMDSO60547 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GMDSO60547 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GMDSO60547 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GMDSO60547 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GMDSO60547 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GMDSO60547 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GMDSO60547 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GMDSO60547 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GMDSO60547 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GMDSO60547 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GMDSO60547 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GMDSO60547 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GMDSO60547 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GMDSO60547 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GMDSO60547 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GMDSO60547 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GMDSO60547 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GMDSO60547 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GMDSO60547 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GMDSO60547 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GMDSO60547 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GMDSO60547 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GMDSO60547 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GMDSO60547 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GMDSO60547 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GMDSO60547 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GMDSO60547 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GMDSO60547 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GMDSO60547 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GMDSO60547 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GMDSO60547 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GMDSO60547 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GMDSO60547 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GMDSO60547 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GMDSO60547 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GMDSO60547 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GMDSO60547 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GMDSO60547 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GMDSO60547 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GMDSO60547 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GMDSO60547 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GMDSO60547 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GMDSO60547 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GMDSO60547 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GMDSO60547 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GMDSO60547 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GMDSO60547 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GMDSO60547 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GMDSO60547 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GMDSO60547 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GMDSO60547 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GMDSO60547 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GMDSO60547 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GMDSO60547 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GMDSO60547 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GMDSO60547 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GMDSO60547 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GMDSO60547 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GMDSO60547 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GMDSO60547 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GMDSO60547 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GMDSO60547 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GMDSO60547 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GMDSO60547 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GMDSO60547 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms