Protein–RNA interactions for Protein: O43196

MSH5, MutS protein homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSH5O43196 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
MSH5O43196 AL391117.1-201ENST00000640003 1186 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MSH5O43196 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MSH5O43196 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MSH5O43196 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MSH5O43196 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MSH5O43196 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MSH5O43196 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MSH5O43196 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MSH5O43196 XCL2-201ENST00000367819 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MSH5O43196 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MSH5O43196 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MSH5O43196 AC114947.1-201ENST00000511991 432 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MSH5O43196 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MSH5O43196 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
MSH5O43196 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MSH5O43196 AC080011.1-201ENST00000552378 989 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MSH5O43196 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
MSH5O43196 AC087821.1-201ENST00000623639 567 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
MSH5O43196 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MSH5O43196 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MSH5O43196 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MSH5O43196 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MSH5O43196 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MSH5O43196 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MSH5O43196 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MSH5O43196 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MSH5O43196 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MSH5O43196 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MSH5O43196 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MSH5O43196 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MSH5O43196 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MSH5O43196 BNIP3P35-201ENST00000604530 490 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
MSH5O43196 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
MSH5O43196 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MSH5O43196 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MSH5O43196 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MSH5O43196 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MSH5O43196 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MSH5O43196 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MSH5O43196 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MSH5O43196 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
MSH5O43196 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MSH5O43196 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MSH5O43196 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MSH5O43196 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MSH5O43196 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MSH5O43196 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MSH5O43196 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MSH5O43196 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MSH5O43196 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MSH5O43196 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MSH5O43196 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MSH5O43196 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MSH5O43196 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MSH5O43196 AL356476.1-201ENST00000421481 480 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MSH5O43196 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MSH5O43196 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MSH5O43196 AC109466.1-206ENST00000522686 774 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MSH5O43196 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MSH5O43196 WWOX-AS1-201ENST00000567099 443 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MSH5O43196 LINC00458-206ENST00000607494 849 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MSH5O43196 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
MSH5O43196 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MSH5O43196 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MSH5O43196 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MSH5O43196 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MSH5O43196 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MSH5O43196 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MSH5O43196 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MSH5O43196 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MSH5O43196 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MSH5O43196 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MSH5O43196 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MSH5O43196 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MSH5O43196 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MSH5O43196 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MSH5O43196 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MSH5O43196 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
MSH5O43196 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MSH5O43196 PPP1R26-AS1-201ENST00000455039 643 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MSH5O43196 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MSH5O43196 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MSH5O43196 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MSH5O43196 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MSH5O43196 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MSH5O43196 AC007228.2-201ENST00000602145 1328 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
MSH5O43196 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
MSH5O43196 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MSH5O43196 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MSH5O43196 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MSH5O43196 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MSH5O43196 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MSH5O43196 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MSH5O43196 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MSH5O43196 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MSH5O43196 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MSH5O43196 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MSH5O43196 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MSH5O43196 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms