Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms