Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

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Length 73 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
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LINC00587B1AMM8 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
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LINC00587B1AMM8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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LINC00587B1AMM8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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LINC00587B1AMM8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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LINC00587B1AMM8 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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LINC00587B1AMM8 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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LINC00587B1AMM8 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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LINC00587B1AMM8 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
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