Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms