Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEU0

VTI1B, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1BQ9UEU0 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VTI1BQ9UEU0 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VTI1BQ9UEU0 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VTI1BQ9UEU0 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VTI1BQ9UEU0 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VTI1BQ9UEU0 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VTI1BQ9UEU0 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VTI1BQ9UEU0 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VTI1BQ9UEU0 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VTI1BQ9UEU0 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VTI1BQ9UEU0 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VTI1BQ9UEU0 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VTI1BQ9UEU0 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VTI1BQ9UEU0 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VTI1BQ9UEU0 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VTI1BQ9UEU0 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
VTI1BQ9UEU0 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
VTI1BQ9UEU0 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VTI1BQ9UEU0 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
VTI1BQ9UEU0 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VTI1BQ9UEU0 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VTI1BQ9UEU0 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VTI1BQ9UEU0 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VTI1BQ9UEU0 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VTI1BQ9UEU0 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms