Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2X0

DPM3, Dolichol-phosphate mannosyltransferase subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPM3Q9P2X0 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DPM3Q9P2X0 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DPM3Q9P2X0 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DPM3Q9P2X0 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DPM3Q9P2X0 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DPM3Q9P2X0 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DPM3Q9P2X0 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DPM3Q9P2X0 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DPM3Q9P2X0 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DPM3Q9P2X0 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DPM3Q9P2X0 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DPM3Q9P2X0 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DPM3Q9P2X0 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DPM3Q9P2X0 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DPM3Q9P2X0 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DPM3Q9P2X0 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DPM3Q9P2X0 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DPM3Q9P2X0 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DPM3Q9P2X0 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DPM3Q9P2X0 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DPM3Q9P2X0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DPM3Q9P2X0 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DPM3Q9P2X0 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DPM3Q9P2X0 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DPM3Q9P2X0 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DPM3Q9P2X0 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DPM3Q9P2X0 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DPM3Q9P2X0 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DPM3Q9P2X0 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DPM3Q9P2X0 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DPM3Q9P2X0 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DPM3Q9P2X0 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DPM3Q9P2X0 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DPM3Q9P2X0 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DPM3Q9P2X0 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DPM3Q9P2X0 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DPM3Q9P2X0 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DPM3Q9P2X0 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DPM3Q9P2X0 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DPM3Q9P2X0 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DPM3Q9P2X0 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DPM3Q9P2X0 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DPM3Q9P2X0 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DPM3Q9P2X0 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DPM3Q9P2X0 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DPM3Q9P2X0 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DPM3Q9P2X0 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DPM3Q9P2X0 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DPM3Q9P2X0 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DPM3Q9P2X0 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DPM3Q9P2X0 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DPM3Q9P2X0 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DPM3Q9P2X0 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DPM3Q9P2X0 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DPM3Q9P2X0 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DPM3Q9P2X0 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DPM3Q9P2X0 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DPM3Q9P2X0 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DPM3Q9P2X0 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DPM3Q9P2X0 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DPM3Q9P2X0 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DPM3Q9P2X0 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DPM3Q9P2X0 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DPM3Q9P2X0 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DPM3Q9P2X0 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DPM3Q9P2X0 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DPM3Q9P2X0 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DPM3Q9P2X0 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DPM3Q9P2X0 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DPM3Q9P2X0 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DPM3Q9P2X0 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DPM3Q9P2X0 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DPM3Q9P2X0 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DPM3Q9P2X0 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DPM3Q9P2X0 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DPM3Q9P2X0 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DPM3Q9P2X0 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DPM3Q9P2X0 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DPM3Q9P2X0 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DPM3Q9P2X0 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DPM3Q9P2X0 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DPM3Q9P2X0 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DPM3Q9P2X0 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DPM3Q9P2X0 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DPM3Q9P2X0 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DPM3Q9P2X0 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DPM3Q9P2X0 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DPM3Q9P2X0 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DPM3Q9P2X0 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DPM3Q9P2X0 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DPM3Q9P2X0 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DPM3Q9P2X0 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DPM3Q9P2X0 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DPM3Q9P2X0 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DPM3Q9P2X0 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DPM3Q9P2X0 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DPM3Q9P2X0 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DPM3Q9P2X0 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DPM3Q9P2X0 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DPM3Q9P2X0 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms