Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms