Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms