Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LIN28AQ9H9Z2 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms