Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN8

C20orf27, UPF0687 protein C20orf27, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf27Q9GZN8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C20orf27Q9GZN8 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C20orf27Q9GZN8 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C20orf27Q9GZN8 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C20orf27Q9GZN8 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C20orf27Q9GZN8 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C20orf27Q9GZN8 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
C20orf27Q9GZN8 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C20orf27Q9GZN8 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C20orf27Q9GZN8 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C20orf27Q9GZN8 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C20orf27Q9GZN8 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C20orf27Q9GZN8 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C20orf27Q9GZN8 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C20orf27Q9GZN8 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C20orf27Q9GZN8 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C20orf27Q9GZN8 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C20orf27Q9GZN8 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C20orf27Q9GZN8 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C20orf27Q9GZN8 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C20orf27Q9GZN8 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C20orf27Q9GZN8 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C20orf27Q9GZN8 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C20orf27Q9GZN8 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C20orf27Q9GZN8 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C20orf27Q9GZN8 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
C20orf27Q9GZN8 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C20orf27Q9GZN8 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C20orf27Q9GZN8 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C20orf27Q9GZN8 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C20orf27Q9GZN8 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C20orf27Q9GZN8 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C20orf27Q9GZN8 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C20orf27Q9GZN8 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
C20orf27Q9GZN8 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C20orf27Q9GZN8 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C20orf27Q9GZN8 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C20orf27Q9GZN8 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
C20orf27Q9GZN8 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C20orf27Q9GZN8 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C20orf27Q9GZN8 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C20orf27Q9GZN8 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C20orf27Q9GZN8 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C20orf27Q9GZN8 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C20orf27Q9GZN8 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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C20orf27Q9GZN8 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C20orf27Q9GZN8 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C20orf27Q9GZN8 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C20orf27Q9GZN8 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C20orf27Q9GZN8 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C20orf27Q9GZN8 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C20orf27Q9GZN8 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C20orf27Q9GZN8 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C20orf27Q9GZN8 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C20orf27Q9GZN8 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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C20orf27Q9GZN8 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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C20orf27Q9GZN8 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C20orf27Q9GZN8 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
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C20orf27Q9GZN8 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C20orf27Q9GZN8 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C20orf27Q9GZN8 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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C20orf27Q9GZN8 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C20orf27Q9GZN8 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C20orf27Q9GZN8 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C20orf27Q9GZN8 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C20orf27Q9GZN8 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C20orf27Q9GZN8 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C20orf27Q9GZN8 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C20orf27Q9GZN8 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C20orf27Q9GZN8 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C20orf27Q9GZN8 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C20orf27Q9GZN8 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C20orf27Q9GZN8 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
C20orf27Q9GZN8 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C20orf27Q9GZN8 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C20orf27Q9GZN8 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C20orf27Q9GZN8 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C20orf27Q9GZN8 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C20orf27Q9GZN8 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C20orf27Q9GZN8 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C20orf27Q9GZN8 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C20orf27Q9GZN8 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C20orf27Q9GZN8 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
C20orf27Q9GZN8 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C20orf27Q9GZN8 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C20orf27Q9GZN8 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C20orf27Q9GZN8 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C20orf27Q9GZN8 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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