Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms