Protein–RNA interactions for Protein: Q96HF1

SFRP2, Secreted frizzled-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP2Q96HF1 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SFRP2Q96HF1 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SFRP2Q96HF1 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SFRP2Q96HF1 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SFRP2Q96HF1 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SFRP2Q96HF1 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SFRP2Q96HF1 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SFRP2Q96HF1 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SFRP2Q96HF1 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SFRP2Q96HF1 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SFRP2Q96HF1 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SFRP2Q96HF1 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SFRP2Q96HF1 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SFRP2Q96HF1 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SFRP2Q96HF1 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SFRP2Q96HF1 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SFRP2Q96HF1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SFRP2Q96HF1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SFRP2Q96HF1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SFRP2Q96HF1 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SFRP2Q96HF1 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SFRP2Q96HF1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SFRP2Q96HF1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SFRP2Q96HF1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SFRP2Q96HF1 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SFRP2Q96HF1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SFRP2Q96HF1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SFRP2Q96HF1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SFRP2Q96HF1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SFRP2Q96HF1 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SFRP2Q96HF1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SFRP2Q96HF1 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SFRP2Q96HF1 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SFRP2Q96HF1 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SFRP2Q96HF1 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SFRP2Q96HF1 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SFRP2Q96HF1 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SFRP2Q96HF1 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SFRP2Q96HF1 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SFRP2Q96HF1 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SFRP2Q96HF1 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SFRP2Q96HF1 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SFRP2Q96HF1 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SFRP2Q96HF1 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SFRP2Q96HF1 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SFRP2Q96HF1 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SFRP2Q96HF1 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SFRP2Q96HF1 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SFRP2Q96HF1 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SFRP2Q96HF1 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SFRP2Q96HF1 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SFRP2Q96HF1 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SFRP2Q96HF1 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SFRP2Q96HF1 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SFRP2Q96HF1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SFRP2Q96HF1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SFRP2Q96HF1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SFRP2Q96HF1 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SFRP2Q96HF1 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SFRP2Q96HF1 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SFRP2Q96HF1 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SFRP2Q96HF1 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SFRP2Q96HF1 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SFRP2Q96HF1 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SFRP2Q96HF1 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SFRP2Q96HF1 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SFRP2Q96HF1 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SFRP2Q96HF1 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SFRP2Q96HF1 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SFRP2Q96HF1 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SFRP2Q96HF1 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SFRP2Q96HF1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SFRP2Q96HF1 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SFRP2Q96HF1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SFRP2Q96HF1 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SFRP2Q96HF1 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SFRP2Q96HF1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SFRP2Q96HF1 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SFRP2Q96HF1 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SFRP2Q96HF1 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SFRP2Q96HF1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SFRP2Q96HF1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SFRP2Q96HF1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SFRP2Q96HF1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SFRP2Q96HF1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SFRP2Q96HF1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SFRP2Q96HF1 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SFRP2Q96HF1 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SFRP2Q96HF1 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SFRP2Q96HF1 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SFRP2Q96HF1 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SFRP2Q96HF1 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SFRP2Q96HF1 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SFRP2Q96HF1 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SFRP2Q96HF1 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SFRP2Q96HF1 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SFRP2Q96HF1 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SFRP2Q96HF1 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFRP2Q96HF1 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFRP2Q96HF1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms