Protein–RNA interactions for Protein: Q8WX93

PALLD, Palladin, humanhuman

Predictions only

Length 1,383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALLDQ8WX93 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms