Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms