Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0U6

LINC00518, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00518, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00518Q8N0U6 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00518Q8N0U6 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00518Q8N0U6 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC00518Q8N0U6 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC00518Q8N0U6 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC00518Q8N0U6 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC00518Q8N0U6 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC00518Q8N0U6 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC00518Q8N0U6 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC00518Q8N0U6 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC00518Q8N0U6 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC00518Q8N0U6 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC00518Q8N0U6 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC00518Q8N0U6 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC00518Q8N0U6 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC00518Q8N0U6 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC00518Q8N0U6 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC00518Q8N0U6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC00518Q8N0U6 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC00518Q8N0U6 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC00518Q8N0U6 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC00518Q8N0U6 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC00518Q8N0U6 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC00518Q8N0U6 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC00518Q8N0U6 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC00518Q8N0U6 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC00518Q8N0U6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC00518Q8N0U6 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms