Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATG9AQ7Z3C6 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms