Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms