Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms