Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWZ7

ABRAXAS1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS1Q6UWZ7 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms