Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 STRADA-224ENST00000617949 705 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.224e-9■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 TM2D2-205ENST00000519186 573 ntTSL 27.39□□□□□ -1.234e-9■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 AL590094.1-203ENST00000435649 828 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.233e-17■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 SBF2-201ENST00000256190 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.234e-9■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 STRADA-210ENST00000579318 1307 ntTSL 27.31□□□□□ -1.244e-9■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 TMCO1-208ENST00000612311 4468 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.253e-10■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 ABRAXAS1-206ENST00000506553 1869 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.254e-9■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 TRAPPC2-201ENST00000359680 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.252e-6■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 STRADA-218ENST00000581505 488 ntTSL 57.21□□□□□ -1.264e-9■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 POGZ-221ENST00000594456 561 nt7.21□□□□□ -1.264e-9■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 NARS2-202ENST00000525345 861 ntTSL 57.13□□□□□ -1.272e-8■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 IFT74-209ENST00000518614 563 ntTSL 57.06□□□□□ -1.284e-9■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 NXF1-215ENST00000533440 579 ntTSL 27.06□□□□□ -1.284e-9■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 ARIH2-220ENST00000482342 441 ntTSL 27.04□□□□□ -1.282e-12■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 STRADA-236ENST00000639192 1076 ntTSL 57□□□□□ -1.294e-9■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 HELQ-201ENST00000295488 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.32e-8■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 USP8-203ENST00000419830 2402 ntTSL 26.91□□□□□ -1.32e-6■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 TM2D2-203ENST00000456845 3295 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.324e-9■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 HELQ-204ENST00000510985 3315 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.322e-8■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 DZANK1-204ENST00000358866 3310 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.332e-6■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 GDAP1-203ENST00000520797 735 ntTSL 36.73□□□□□ -1.333e-17■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 HELB-204ENST00000542394 3432 ntTSL 1 (best)6.64□□□□□ -1.354e-9■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 ATP2B1-211ENST00000635033 1358 ntTSL 56.45□□□□□ -1.384e-9■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 KLC4-210ENST00000468114 527 ntTSL 26.4□□□□□ -1.383e-17■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 HELB-201ENST00000247815 12866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.394e-9■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 SDAD1-205ENST00000503411 802 ntTSL 36.32□□□□□ -1.44e-9■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 DARS-205ENST00000449218 543 ntTSL 36.2□□□□□ -1.422e-8■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 DZANK1-205ENST00000377630 3295 ntTSL 26.13□□□□□ -1.432e-6■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 ZNF607-202ENST00000395835 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.434e-9■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 POGZ-212ENST00000485040 2741 ntTSL 1 (best)6.06□□□□□ -1.444e-9■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 IFT74-202ENST00000429045 1462 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.444e-9■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 SEC23B-208ENST00000494645 473 ntTSL 25.87□□□□□ -1.472e-7■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 DYNC2LI1-203ENST00000398823 2903 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.474e-9■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 TM2D2-207ENST00000521060 284 ntTSL 25.76□□□□□ -1.494e-9■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 ATP5B-208ENST00000551182 457 ntTSL 25.75□□□□□ -1.494e-9■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 HELB-205ENST00000545134 3586 ntTSL 25.72□□□□□ -1.494e-9■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 DZANK1-203ENST00000357236 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.492e-6■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 PPP1R12A-210ENST00000548908 3066 ntTSL 55.62□□□□□ -1.511e-6■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 PIK3R3-202ENST00000372006 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.534e-9■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.534e-9■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 SLC25A12-202ENST00000422440 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.535e-8■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 RRM2-205ENST00000462343 454 ntTSL 25.46□□□□□ -1.548e-7■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 SLC25A12-201ENST00000263812 2429 ntTSL 25.46□□□□□ -1.545e-8■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 VPS13C-206ENST00000558338 1863 ntTSL 25.43□□□□□ -1.548e-9■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 ARID4B-206ENST00000444620 1660 ntTSL 55.33□□□□□ -1.564e-9■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 OSBPL8-213ENST00000550865 642 ntTSL 25.32□□□□□ -1.564e-9■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 TRAPPC2-203ENST00000380579 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.572e-6■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 STRADA-242ENST00000639940 456 ntTSL 55.23□□□□□ -1.574e-9■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 STRADA-248ENST00000640707 1300 ntTSL 55.21□□□□□ -1.584e-9■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 POGZ-207ENST00000441516 526 ntTSL 35.2□□□□□ -1.584e-9■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 ARID4B-209ENST00000471257 4195 ntTSL 55.13□□□□□ -1.594e-9■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 PIP5K1A-212ENST00000464105 653 ntTSL 54.95□□□□□ -1.624e-9■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 IFT74-204ENST00000443698 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.634e-9■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 KIAA0100-213ENST00000582417 574 ntTSL 34.86□□□□□ -1.634e-9■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 PSMD5-204ENST00000373920 569 ntTSL 54.84□□□□□ -1.634e-9■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 NF1-217ENST00000498569 620 ntTSL 24.75□□□□□ -1.654e-9■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 USP39-213ENST00000467885 338 ntTSL 54.73□□□□□ -1.657e-7■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 TRAPPC2-207ENST00000519382 1411 ntTSL 24.66□□□□□ -1.662e-6■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 PPP1R12A-214ENST00000550299 683 ntTSL 54.64□□□□□ -1.671e-6■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 C5orf51-204ENST00000612065 1391 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.674e-9■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.674e-9■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 METTL3-203ENST00000377543 563 ntTSL 34.61□□□□□ -1.674e-9■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 SEPT7-204ENST00000425198 6952 ntTSL 54.45□□□□□ -1.74e-9■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.713e-6■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 PPARGC1A-207ENST00000508380 576 ntTSL 44.36□□□□□ -1.714e-9■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.722e-6■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 PRRC1-203ENST00000507774 703 ntTSL 24.24□□□□□ -1.734e-9■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 VPS33A-203ENST00000536212 567 ntTSL 43.99□□□□□ -1.774e-9■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 PIK3R3-207ENST00000493202 765 ntTSL 33.84□□□□□ -1.794e-9■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 TTC37-202ENST00000502768 917 ntTSL 33.81□□□□□ -1.84e-9■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 GEMIN2-210ENST00000529365 583 ntTSL 33.81□□□□□ -1.84e-9■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.82e-6■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 IMPAD1-203ENST00000520392 584 ntTSL 23.66□□□□□ -1.823e-17■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 SLC25A3-207ENST00000547869 1018 ntTSL 23.41□□□□□ -1.863e-25■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 PPARGC1A-210ENST00000512169 550 ntTSL 43.3□□□□□ -1.884e-9■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 EDEM3-205ENST00000466606 487 ntTSL 32.98□□□□□ -1.934e-9■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 PPP1R12A-205ENST00000546762 1257 ntTSL 52.9□□□□□ -1.951e-6■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 PPP1R12A-217ENST00000550903 959 ntTSL 52.9□□□□□ -1.951e-6■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 PTPN4-204ENST00000431283 630 ntTSL 32.9□□□□□ -1.954e-9■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 SEPT7-217ENST00000635175 1464 ntTSL 22.86□□□□□ -1.954e-9■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 RSBN1L-206ENST00000468035 585 ntTSL 32.86□□□□□ -1.954e-9■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 STXBP4-206ENST00000463234 423 ntTSL 32.86□□□□□ -1.952e-6■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 ABRAXAS1-205ENST00000505489 847 ntTSL 52.81□□□□□ -1.964e-9■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 RRP15-202ENST00000491428 492 ntTSL 1 (best)2.76□□□□□ -1.974e-9■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 RFC1-208ENST00000504849 873 ntTSL 32.73□□□□□ -1.974e-9■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 SPC25-202ENST00000451987 596 ntTSL 32.63□□□□□ -1.994e-9■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 ROBO1-203ENST00000466906 550 ntTSL 42.6□□□□□ -1.994e-9■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 SBF2-214ENST00000533770 4829 ntTSL 1 (best)2.54□□□□□ -24e-9■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 DPH6-206ENST00000559784 491 ntTSL 32.37□□□□□ -2.034e-9■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 TRPM7-208ENST00000561267 830 ntTSL 32.2□□□□□ -2.063e-10■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.064e-9■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 MTCH2-205ENST00000534074 811 ntTSL 22.07□□□□□ -2.084e-9■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 TRPM7-204ENST00000560516 732 ntTSL 31.94□□□□□ -2.14e-9■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.14e-9■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 GK-206ENST00000425166 371 ntTSL 51.89□□□□□ -2.112e-10■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.114e-9■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 GEMIN2-206ENST00000524980 662 ntTSL 21.73□□□□□ -2.134e-9■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.144e-9■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.154e-9■■■■■ 34.1
PRPF8Q6P2Q9 SLC25A3-210ENST00000548480 722 ntTSL 21.55□□□□□ -2.163e-25■■■■■ 34.1
Retrieved 100 of 73,762 protein–RNA pairs in 1970.6 ms