Protein–RNA interactions for Protein: Q6NY19

KANK3, KN motif and ankyrin repeat domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KANK3Q6NY19 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KANK3Q6NY19 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KANK3Q6NY19 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KANK3Q6NY19 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KANK3Q6NY19 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KANK3Q6NY19 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KANK3Q6NY19 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KANK3Q6NY19 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KANK3Q6NY19 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KANK3Q6NY19 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KANK3Q6NY19 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KANK3Q6NY19 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KANK3Q6NY19 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KANK3Q6NY19 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KANK3Q6NY19 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KANK3Q6NY19 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KANK3Q6NY19 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
KANK3Q6NY19 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KANK3Q6NY19 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KANK3Q6NY19 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KANK3Q6NY19 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KANK3Q6NY19 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KANK3Q6NY19 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KANK3Q6NY19 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KANK3Q6NY19 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KANK3Q6NY19 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KANK3Q6NY19 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KANK3Q6NY19 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KANK3Q6NY19 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KANK3Q6NY19 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KANK3Q6NY19 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KANK3Q6NY19 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KANK3Q6NY19 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KANK3Q6NY19 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KANK3Q6NY19 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
KANK3Q6NY19 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
KANK3Q6NY19 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KANK3Q6NY19 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KANK3Q6NY19 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KANK3Q6NY19 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KANK3Q6NY19 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KANK3Q6NY19 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KANK3Q6NY19 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KANK3Q6NY19 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KANK3Q6NY19 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KANK3Q6NY19 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KANK3Q6NY19 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KANK3Q6NY19 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KANK3Q6NY19 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KANK3Q6NY19 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KANK3Q6NY19 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KANK3Q6NY19 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KANK3Q6NY19 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KANK3Q6NY19 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KANK3Q6NY19 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KANK3Q6NY19 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KANK3Q6NY19 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KANK3Q6NY19 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KANK3Q6NY19 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KANK3Q6NY19 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KANK3Q6NY19 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
KANK3Q6NY19 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KANK3Q6NY19 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KANK3Q6NY19 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KANK3Q6NY19 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
KANK3Q6NY19 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KANK3Q6NY19 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KANK3Q6NY19 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KANK3Q6NY19 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KANK3Q6NY19 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KANK3Q6NY19 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KANK3Q6NY19 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KANK3Q6NY19 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KANK3Q6NY19 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KANK3Q6NY19 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KANK3Q6NY19 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KANK3Q6NY19 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KANK3Q6NY19 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KANK3Q6NY19 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
KANK3Q6NY19 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KANK3Q6NY19 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KANK3Q6NY19 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KANK3Q6NY19 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
KANK3Q6NY19 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KANK3Q6NY19 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KANK3Q6NY19 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KANK3Q6NY19 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KANK3Q6NY19 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KANK3Q6NY19 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KANK3Q6NY19 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KANK3Q6NY19 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KANK3Q6NY19 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KANK3Q6NY19 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KANK3Q6NY19 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KANK3Q6NY19 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
KANK3Q6NY19 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KANK3Q6NY19 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KANK3Q6NY19 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KANK3Q6NY19 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KANK3Q6NY19 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms