Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms