Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
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PTPROQ16827 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
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PTPROQ16827 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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PTPROQ16827 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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