Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms