Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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