Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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