Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms