Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FGD1P98174 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FGD1P98174 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FGD1P98174 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FGD1P98174 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FGD1P98174 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FGD1P98174 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FGD1P98174 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FGD1P98174 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FGD1P98174 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FGD1P98174 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FGD1P98174 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FGD1P98174 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FGD1P98174 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FGD1P98174 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FGD1P98174 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FGD1P98174 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FGD1P98174 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FGD1P98174 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FGD1P98174 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FGD1P98174 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FGD1P98174 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FGD1P98174 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FGD1P98174 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FGD1P98174 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FGD1P98174 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FGD1P98174 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FGD1P98174 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FGD1P98174 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FGD1P98174 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FGD1P98174 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FGD1P98174 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FGD1P98174 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FGD1P98174 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FGD1P98174 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FGD1P98174 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FGD1P98174 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FGD1P98174 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FGD1P98174 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
FGD1P98174 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FGD1P98174 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FGD1P98174 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FGD1P98174 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FGD1P98174 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FGD1P98174 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FGD1P98174 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
FGD1P98174 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FGD1P98174 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
FGD1P98174 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FGD1P98174 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FGD1P98174 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FGD1P98174 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
FGD1P98174 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FGD1P98174 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FGD1P98174 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FGD1P98174 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FGD1P98174 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FGD1P98174 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FGD1P98174 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FGD1P98174 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGD1P98174 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGD1P98174 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGD1P98174 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGD1P98174 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGD1P98174 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGD1P98174 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGD1P98174 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGD1P98174 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGD1P98174 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGD1P98174 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGD1P98174 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FGD1P98174 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGD1P98174 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGD1P98174 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGD1P98174 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGD1P98174 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FGD1P98174 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FGD1P98174 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGD1P98174 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FGD1P98174 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGD1P98174 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGD1P98174 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGD1P98174 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGD1P98174 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGD1P98174 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGD1P98174 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGD1P98174 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGD1P98174 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGD1P98174 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGD1P98174 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGD1P98174 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FGD1P98174 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGD1P98174 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGD1P98174 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGD1P98174 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGD1P98174 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGD1P98174 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGD1P98174 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGD1P98174 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGD1P98174 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms