Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms