Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCLCP48506 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCLCP48506 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCLCP48506 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCLCP48506 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCLCP48506 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GCLCP48506 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCLCP48506 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GCLCP48506 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCLCP48506 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GCLCP48506 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCLCP48506 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCLCP48506 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCLCP48506 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCLCP48506 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCLCP48506 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GCLCP48506 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCLCP48506 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCLCP48506 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCLCP48506 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCLCP48506 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCLCP48506 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GCLCP48506 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCLCP48506 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCLCP48506 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCLCP48506 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCLCP48506 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCLCP48506 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCLCP48506 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCLCP48506 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCLCP48506 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCLCP48506 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCLCP48506 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCLCP48506 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCLCP48506 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCLCP48506 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCLCP48506 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCLCP48506 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCLCP48506 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GCLCP48506 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCLCP48506 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCLCP48506 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCLCP48506 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCLCP48506 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCLCP48506 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GCLCP48506 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GCLCP48506 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GCLCP48506 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GCLCP48506 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GCLCP48506 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GCLCP48506 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GCLCP48506 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GCLCP48506 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GCLCP48506 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GCLCP48506 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GCLCP48506 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GCLCP48506 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GCLCP48506 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GCLCP48506 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GCLCP48506 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GCLCP48506 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GCLCP48506 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GCLCP48506 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GCLCP48506 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GCLCP48506 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GCLCP48506 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GCLCP48506 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GCLCP48506 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GCLCP48506 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GCLCP48506 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GCLCP48506 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GCLCP48506 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GCLCP48506 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GCLCP48506 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GCLCP48506 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GCLCP48506 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GCLCP48506 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GCLCP48506 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GCLCP48506 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GCLCP48506 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GCLCP48506 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GCLCP48506 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GCLCP48506 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GCLCP48506 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GCLCP48506 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GCLCP48506 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GCLCP48506 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GCLCP48506 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GCLCP48506 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GCLCP48506 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GCLCP48506 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GCLCP48506 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GCLCP48506 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GCLCP48506 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GCLCP48506 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GCLCP48506 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GCLCP48506 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GCLCP48506 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GCLCP48506 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GCLCP48506 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms