Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYT1P21579 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYT1P21579 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYT1P21579 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SYT1P21579 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYT1P21579 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYT1P21579 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYT1P21579 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYT1P21579 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYT1P21579 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYT1P21579 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYT1P21579 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SYT1P21579 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SYT1P21579 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SYT1P21579 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYT1P21579 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYT1P21579 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYT1P21579 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYT1P21579 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYT1P21579 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYT1P21579 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYT1P21579 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYT1P21579 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYT1P21579 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYT1P21579 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYT1P21579 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYT1P21579 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYT1P21579 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYT1P21579 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYT1P21579 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYT1P21579 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SYT1P21579 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYT1P21579 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYT1P21579 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYT1P21579 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYT1P21579 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYT1P21579 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SYT1P21579 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYT1P21579 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYT1P21579 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYT1P21579 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SYT1P21579 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYT1P21579 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYT1P21579 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYT1P21579 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYT1P21579 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYT1P21579 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYT1P21579 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYT1P21579 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYT1P21579 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYT1P21579 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYT1P21579 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SYT1P21579 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SYT1P21579 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYT1P21579 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYT1P21579 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYT1P21579 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYT1P21579 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYT1P21579 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYT1P21579 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYT1P21579 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYT1P21579 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYT1P21579 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYT1P21579 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYT1P21579 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SYT1P21579 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYT1P21579 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYT1P21579 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYT1P21579 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYT1P21579 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYT1P21579 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYT1P21579 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYT1P21579 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYT1P21579 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SYT1P21579 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SYT1P21579 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYT1P21579 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYT1P21579 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYT1P21579 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYT1P21579 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYT1P21579 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYT1P21579 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYT1P21579 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYT1P21579 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYT1P21579 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYT1P21579 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYT1P21579 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYT1P21579 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYT1P21579 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYT1P21579 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYT1P21579 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYT1P21579 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYT1P21579 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYT1P21579 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYT1P21579 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYT1P21579 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYT1P21579 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYT1P21579 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYT1P21579 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYT1P21579 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms