Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPN2P17655 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPN2P17655 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPN2P17655 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPN2P17655 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPN2P17655 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPN2P17655 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPN2P17655 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPN2P17655 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPN2P17655 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPN2P17655 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPN2P17655 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPN2P17655 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPN2P17655 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPN2P17655 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPN2P17655 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPN2P17655 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPN2P17655 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPN2P17655 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPN2P17655 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPN2P17655 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPN2P17655 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPN2P17655 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPN2P17655 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPN2P17655 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPN2P17655 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPN2P17655 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPN2P17655 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPN2P17655 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPN2P17655 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPN2P17655 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPN2P17655 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPN2P17655 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPN2P17655 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPN2P17655 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPN2P17655 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPN2P17655 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPN2P17655 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPN2P17655 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPN2P17655 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPN2P17655 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPN2P17655 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPN2P17655 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPN2P17655 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPN2P17655 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPN2P17655 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPN2P17655 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPN2P17655 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPN2P17655 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPN2P17655 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPN2P17655 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPN2P17655 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPN2P17655 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPN2P17655 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPN2P17655 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPN2P17655 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPN2P17655 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPN2P17655 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPN2P17655 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPN2P17655 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPN2P17655 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPN2P17655 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPN2P17655 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPN2P17655 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPN2P17655 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPN2P17655 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPN2P17655 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPN2P17655 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPN2P17655 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPN2P17655 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPN2P17655 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPN2P17655 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPN2P17655 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPN2P17655 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPN2P17655 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPN2P17655 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPN2P17655 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPN2P17655 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPN2P17655 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPN2P17655 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPN2P17655 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPN2P17655 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPN2P17655 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPN2P17655 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPN2P17655 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPN2P17655 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPN2P17655 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPN2P17655 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPN2P17655 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPN2P17655 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPN2P17655 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPN2P17655 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPN2P17655 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPN2P17655 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPN2P17655 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPN2P17655 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPN2P17655 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPN2P17655 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPN2P17655 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPN2P17655 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms