Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 TTLL4-221ENST00000494428 829 ntTSL 38.48□□□□□ -1.052e-11■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 PPIA-204ENST00000468812 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.063e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 OPTN-203ENST00000378748 3521 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.063e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 AC013489.1-201ENST00000561140 598 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.063e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ALG13-216ENST00000486353 916 ntTSL 58.42□□□□□ -1.063e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 EPS15L1-214ENST00000602009 3915 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.063e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 KCNN3-201ENST00000271915 13033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.063e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 EIF3L-207ENST00000450376 520 ntTSL 58.4□□□□□ -1.063e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ERICH1-209ENST00000523415 3630 ntTSL 28.4□□□□□ -1.063e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 THADA-209ENST00000408045 5585 ntTSL 1 (best)8.38□□□□□ -1.073e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 EPB41L2-223ENST00000530148 664 ntTSL 48.37□□□□□ -1.073e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 CDADC1-206ENST00000496952 706 ntTSL 38.36□□□□□ -1.073e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ENTPD5-201ENST00000334696 5842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.073e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 LMBR1L-226ENST00000552449 277 ntTSL 38.35□□□□□ -1.073e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 CHN2-208ENST00000412711 2991 ntTSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.073e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 SAMD4A-206ENST00000555091 547 ntTSL 48.34□□□□□ -1.073e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 MXI1-204ENST00000369612 879 ntTSL 3 BASIC8.33□□□□□ -1.083e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 XIRP2-202ENST00000409043 3292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.083e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ZNF131-209ENST00000507393 583 ntTSL 48.32□□□□□ -1.082e-11■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 COMMD9-202ENST00000355500 2738 ntTSL 28.32□□□□□ -1.083e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 TMEM234-212ENST00000495091 379 ntTSL 58.3□□□□□ -1.083e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 AC135050.6-202ENST00000613584 392 ntBASIC8.27□□□□□ -1.093e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 CD99L2-209ENST00000634795 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 58.26□□□□□ -1.093e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ZNF143-211ENST00000526657 565 ntTSL 48.25□□□□□ -1.093e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 FAR2-204ENST00000547411 558 ntTSL 48.24□□□□□ -1.093e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 AC010894.3-201ENST00000442996 2400 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.093e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 TMEM192-201ENST00000306480 10012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.093e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ATXN1-204ENST00000473388 1569 ntTSL 1 (best)8.22□□□□□ -1.093e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 NBR1-201ENST00000341165 4656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.13e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 CYB5A-204ENST00000494131 776 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.13e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 SSBP2-213ENST00000509743 779 ntTSL 48.18□□□□□ -1.13e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 KCTD10-207ENST00000538377 708 ntTSL 28.18□□□□□ -1.13e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 DCLRE1C-211ENST00000396817 2761 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.13e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ZNF410-207ENST00000541357 1212 ntTSL 28.17□□□□□ -1.13e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ZNF410-205ENST00000442160 2076 ntTSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.113e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 LINC00159-202ENST00000414877 428 ntTSL 4 BASIC8.13□□□□□ -1.113e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 PHLPP1-207ENST00000591386 591 ntTSL 58.13□□□□□ -1.113e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 GGCX-201ENST00000233838 7569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.113e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 AC027097.2-201ENST00000588925 1976 ntTSL 2 BASIC8.11□□□□□ -1.113e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 CHD8-209ENST00000555935 2617 ntTSL 58.1□□□□□ -1.113e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 RNF144A-202ENST00000416587 564 ntTSL 58.09□□□□□ -1.113e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 CCDC150-201ENST00000389175 3685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.123e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 PHLPP1-206ENST00000591106 549 ntTSL 48.08□□□□□ -1.123e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 COPS3-203ENST00000439936 1394 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.123e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 KDM1B-203ENST00000546309 496 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.123e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 CDADC1-201ENST00000251108 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.123e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 CEP70-209ENST00000478673 974 ntTSL 28.03□□□□□ -1.123e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 NUFIP1-201ENST00000379161 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.133e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 RBM22-203ENST00000518917 566 ntTSL 58.02□□□□□ -1.133e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 PKNOX1-205ENST00000474336 438 ntTSL 28.02□□□□□ -1.133e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 LINC01572-204ENST00000570035 831 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.133e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 CCDC162P-202ENST00000368966 6751 ntBASIC8□□□□□ -1.133e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 SPARC-201ENST00000231061 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.133e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 TTLL4-204ENST00000417196 811 ntTSL 57.99□□□□□ -1.132e-11■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 PPFIA1-215ENST00000530548 3774 ntTSL 27.97□□□□□ -1.133e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 FBXW11-209ENST00000522376 713 ntTSL 57.97□□□□□ -1.133e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 CS-204ENST00000546621 1513 ntTSL 27.96□□□□□ -1.133e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 RHOH-215ENST00000515702 574 ntTSL 47.96□□□□□ -1.143e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 SLC41A2-204ENST00000417469 563 ntTSL 47.95□□□□□ -1.143e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 LIMA1-216ENST00000552909 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.143e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ARMCX5-203ENST00000473968 782 ntTSL 27.94□□□□□ -1.143e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 CCNDBP1-212ENST00000567690 936 ntTSL 57.9□□□□□ -1.142e-11■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ASCC1-201ENST00000317126 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.153e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 FBXO25-207ENST00000519274 826 ntTSL 37.89□□□□□ -1.153e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 FARSB-201ENST00000281828 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.153e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 NUMB-214ENST00000555238 3588 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.152e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 LRRC37A-201ENST00000320254 5177 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.153e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 NAPEPLD-209ENST00000465647 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.153e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 GON4L-209ENST00000471341 5097 ntTSL 27.84□□□□□ -1.153e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 THADA-204ENST00000403856 6939 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.163e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 RASGRP1-202ENST00000414708 2151 ntTSL 1 (best)7.82□□□□□ -1.163e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ZNF131-219ENST00000514169 476 ntTSL 37.8□□□□□ -1.162e-11■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 SMAD4-210ENST00000590061 544 ntTSL 47.79□□□□□ -1.163e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 TRIM5-202ENST00000380034 2991 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.175e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 GTDC1-212ENST00000463875 1563 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.173e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 MXI1-209ENST00000484030 838 ntTSL 57.73□□□□□ -1.173e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 GON4L-201ENST00000271883 7138 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.173e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 PHLPP2-201ENST00000393524 8467 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.173e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ZMYND11-216ENST00000602682 1687 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.183e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ZNF426-201ENST00000253115 7085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.183e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ZMYND11-215ENST00000558098 1859 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.183e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 CHCHD3-206ENST00000496427 721 ntTSL 57.68□□□□□ -1.188e-7■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 CHIC1-201ENST00000373502 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.183e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 NF1P8-201ENST00000415351 1461 ntBASIC7.67□□□□□ -1.183e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 GTF2E1-201ENST00000283875 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.183e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 FAR2-202ENST00000536681 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.183e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ATR-201ENST00000350721 8249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.183e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 BCO2-203ENST00000438022 2598 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.193e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 KCNN3-205ENST00000618040 13057 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.193e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ATXN1-210ENST00000498374 1648 ntTSL 1 (best)7.6□□□□□ -1.193e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ELMO2-217ENST00000488853 1250 ntTSL 57.6□□□□□ -1.193e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 FBXO15-203ENST00000578399 827 ntTSL 37.6□□□□□ -1.193e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 SCG5-201ENST00000300175 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.193e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 KPNA2-207ENST00000584026 561 ntTSL 47.59□□□□□ -1.191e-16■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 DLD-207ENST00000451081 930 ntTSL 1 (best)7.59□□□□□ -1.193e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 RHOH-212ENST00000514143 587 ntTSL 37.58□□□□□ -1.23e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 SOS2-202ENST00000543680 3960 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.23e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 FCF1-201ENST00000341162 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.23e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 INPP5B-208ENST00000470364 439 ntTSL 37.55□□□□□ -1.23e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ATXN1-205ENST00000479680 568 ntTSL 47.53□□□□□ -1.23e-6■■■■■ 137.9
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