Protein–RNA interactions for Protein: O60830

TIMM17B, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17-B, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17BO60830 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
TIMM17BO60830 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
TIMM17BO60830 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
TIMM17BO60830 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
TIMM17BO60830 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TIMM17BO60830 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TIMM17BO60830 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TIMM17BO60830 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TIMM17BO60830 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TIMM17BO60830 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TIMM17BO60830 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TIMM17BO60830 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TIMM17BO60830 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TIMM17BO60830 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TIMM17BO60830 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TIMM17BO60830 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TIMM17BO60830 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TIMM17BO60830 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TIMM17BO60830 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TIMM17BO60830 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TIMM17BO60830 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TIMM17BO60830 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TIMM17BO60830 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TIMM17BO60830 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TIMM17BO60830 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TIMM17BO60830 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TIMM17BO60830 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TIMM17BO60830 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TIMM17BO60830 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TIMM17BO60830 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TIMM17BO60830 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TIMM17BO60830 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
TIMM17BO60830 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TIMM17BO60830 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TIMM17BO60830 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TIMM17BO60830 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TIMM17BO60830 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TIMM17BO60830 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TIMM17BO60830 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TIMM17BO60830 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TIMM17BO60830 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TIMM17BO60830 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TIMM17BO60830 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TIMM17BO60830 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TIMM17BO60830 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TIMM17BO60830 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TIMM17BO60830 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TIMM17BO60830 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TIMM17BO60830 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
TIMM17BO60830 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TIMM17BO60830 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TIMM17BO60830 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TIMM17BO60830 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TIMM17BO60830 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TIMM17BO60830 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TIMM17BO60830 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TIMM17BO60830 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TIMM17BO60830 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TIMM17BO60830 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TIMM17BO60830 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TIMM17BO60830 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TIMM17BO60830 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TIMM17BO60830 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TIMM17BO60830 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TIMM17BO60830 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TIMM17BO60830 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TIMM17BO60830 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
TIMM17BO60830 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TIMM17BO60830 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TIMM17BO60830 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TIMM17BO60830 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TIMM17BO60830 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TIMM17BO60830 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TIMM17BO60830 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TIMM17BO60830 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TIMM17BO60830 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TIMM17BO60830 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TIMM17BO60830 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TIMM17BO60830 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TIMM17BO60830 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TIMM17BO60830 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TIMM17BO60830 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TIMM17BO60830 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TIMM17BO60830 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TIMM17BO60830 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TIMM17BO60830 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TIMM17BO60830 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms