Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.42
LRRTM2O43300 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
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