Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
APAF1O14727 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
APAF1O14727 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APAF1O14727 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APAF1O14727 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APAF1O14727 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APAF1O14727 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
APAF1O14727 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
APAF1O14727 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
APAF1O14727 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APAF1O14727 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
APAF1O14727 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
APAF1O14727 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APAF1O14727 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
APAF1O14727 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
APAF1O14727 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
APAF1O14727 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APAF1O14727 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
APAF1O14727 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APAF1O14727 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APAF1O14727 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APAF1O14727 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APAF1O14727 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APAF1O14727 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APAF1O14727 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
APAF1O14727 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APAF1O14727 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APAF1O14727 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
APAF1O14727 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APAF1O14727 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APAF1O14727 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APAF1O14727 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
APAF1O14727 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APAF1O14727 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APAF1O14727 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APAF1O14727 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APAF1O14727 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APAF1O14727 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APAF1O14727 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
APAF1O14727 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
APAF1O14727 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
APAF1O14727 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
APAF1O14727 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
APAF1O14727 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
APAF1O14727 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
APAF1O14727 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
APAF1O14727 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
APAF1O14727 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
APAF1O14727 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
APAF1O14727 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
APAF1O14727 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
APAF1O14727 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
APAF1O14727 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
APAF1O14727 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
APAF1O14727 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
APAF1O14727 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
APAF1O14727 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
APAF1O14727 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
APAF1O14727 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
APAF1O14727 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
APAF1O14727 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
APAF1O14727 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
APAF1O14727 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
APAF1O14727 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
APAF1O14727 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
APAF1O14727 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
APAF1O14727 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
APAF1O14727 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
APAF1O14727 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
APAF1O14727 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
APAF1O14727 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
APAF1O14727 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
APAF1O14727 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
APAF1O14727 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
APAF1O14727 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
APAF1O14727 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
APAF1O14727 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
APAF1O14727 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
APAF1O14727 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
APAF1O14727 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
APAF1O14727 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
APAF1O14727 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
APAF1O14727 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
APAF1O14727 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
APAF1O14727 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
APAF1O14727 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
APAF1O14727 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
APAF1O14727 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
APAF1O14727 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
APAF1O14727 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
APAF1O14727 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
APAF1O14727 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
APAF1O14727 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
APAF1O14727 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
APAF1O14727 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
APAF1O14727 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
APAF1O14727 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
APAF1O14727 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
APAF1O14727 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
APAF1O14727 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms