Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms