Protein–RNA interactions for Protein: A6NJW9

CD8B2, Putative T-cell surface glycoprotein CD8 beta-2 chain, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8B2A6NJW9 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD8B2A6NJW9 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD8B2A6NJW9 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD8B2A6NJW9 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD8B2A6NJW9 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD8B2A6NJW9 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD8B2A6NJW9 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD8B2A6NJW9 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD8B2A6NJW9 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD8B2A6NJW9 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD8B2A6NJW9 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD8B2A6NJW9 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD8B2A6NJW9 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD8B2A6NJW9 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD8B2A6NJW9 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD8B2A6NJW9 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD8B2A6NJW9 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD8B2A6NJW9 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD8B2A6NJW9 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD8B2A6NJW9 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD8B2A6NJW9 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD8B2A6NJW9 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD8B2A6NJW9 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD8B2A6NJW9 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CD8B2A6NJW9 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD8B2A6NJW9 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD8B2A6NJW9 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CD8B2A6NJW9 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD8B2A6NJW9 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD8B2A6NJW9 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD8B2A6NJW9 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD8B2A6NJW9 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD8B2A6NJW9 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD8B2A6NJW9 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD8B2A6NJW9 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD8B2A6NJW9 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD8B2A6NJW9 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD8B2A6NJW9 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD8B2A6NJW9 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD8B2A6NJW9 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD8B2A6NJW9 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD8B2A6NJW9 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD8B2A6NJW9 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD8B2A6NJW9 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD8B2A6NJW9 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD8B2A6NJW9 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD8B2A6NJW9 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD8B2A6NJW9 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD8B2A6NJW9 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD8B2A6NJW9 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD8B2A6NJW9 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD8B2A6NJW9 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD8B2A6NJW9 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD8B2A6NJW9 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD8B2A6NJW9 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD8B2A6NJW9 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD8B2A6NJW9 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD8B2A6NJW9 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD8B2A6NJW9 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD8B2A6NJW9 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD8B2A6NJW9 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD8B2A6NJW9 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD8B2A6NJW9 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD8B2A6NJW9 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD8B2A6NJW9 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD8B2A6NJW9 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD8B2A6NJW9 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD8B2A6NJW9 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD8B2A6NJW9 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD8B2A6NJW9 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD8B2A6NJW9 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD8B2A6NJW9 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD8B2A6NJW9 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD8B2A6NJW9 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD8B2A6NJW9 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD8B2A6NJW9 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD8B2A6NJW9 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD8B2A6NJW9 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CD8B2A6NJW9 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD8B2A6NJW9 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD8B2A6NJW9 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CD8B2A6NJW9 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD8B2A6NJW9 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD8B2A6NJW9 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD8B2A6NJW9 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD8B2A6NJW9 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD8B2A6NJW9 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD8B2A6NJW9 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD8B2A6NJW9 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD8B2A6NJW9 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD8B2A6NJW9 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD8B2A6NJW9 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD8B2A6NJW9 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD8B2A6NJW9 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD8B2A6NJW9 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD8B2A6NJW9 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD8B2A6NJW9 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD8B2A6NJW9 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD8B2A6NJW9 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD8B2A6NJW9 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms