Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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USP18Q9UMW8 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
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USP18Q9UMW8 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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USP18Q9UMW8 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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USP18Q9UMW8 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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USP18Q9UMW8 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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USP18Q9UMW8 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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