Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTNNA3Q9UI47 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms