Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VNN3Q9NY84 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms